自民國97年520以來，蒙藏委員會在中華民國憲法架構下，依據馬總統揭示的施政理念及行政院院長擘劃的施政方針，針對我國當前社會環境及未來發展需要，編定本會業務面向包含國際、兩岸及國內事務，其性質並涉及蒙藏方面之國民照護、對外交流與人道援助、文化傳揚、藏傳佛教、學術研究，據以推動各項創新措施及服務，近三年來成果豐碩，實質增進了臺灣人民福祉，未來除繼續推展原有工作外，更將兩岸蒙藏事務交流及扶助蒙藏民族納入施政重點工作，仍本於落實馬總統「以臺灣為主，對人民有利」的核心價值，以及秉持強化交流，促進和解互信的施政重點，克服困難，向上躍升；也會傾聽人民聲音，加強和各相關主管機關協調與合作，建立協處機制，妥慎推動兩岸蒙藏事務交流及扶助蒙藏民族。謹將本會施政績效重要部分列舉如下。

更多績效資料請見行政院-政府施政績效專區

一、臺蒙資源都豐富，交流分享不孤獨（蒙古法官、檢察官研習）
二、臺蒙資源都豐富，交流分享不孤獨（蒙古警察警政研習）
三、臺蒙資源都豐富，交流分享不孤獨（蒙古臺蒙職訓中心）
四、臺蒙資源都豐富，交流分享不孤獨（醫療援助蒙古族）
五、臺蒙資源都豐富，交流分享不孤獨（蒙族青年研習中文）
六、蒙古醫與藥引介來臺
七、沙塵暴防治（兩岸研討會）
八、臺灣與大陸內蒙古大專青年交流
九、蒙古歌舞來臺交流
十、開啟兩岸蒙古文教交流
十一、在臺藏家生活好，社會和諧煩惱少
十二、藏傳佛學團體及藏僧安心弘法
十三、培訓志工及援助海外藏族，臺灣視野廣且寬
十四、兩岸蒙藏舞蹈藝術交流
十五、編印「百年蒙藏」紀念專刊
十六、辦理中國大陸蒙古、西藏文物精品來臺巡迴展覽
十七、走動式展覽，蒙藏文化深入全國各地民間
十八、蒙藏學術研究平臺流通蒙藏研究資料